Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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CUL3Q13618 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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CUL3Q13618 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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CUL3Q13618 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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CUL3Q13618 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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CUL3Q13618 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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CUL3Q13618 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CUL3Q13618 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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CUL3Q13618 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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CUL3Q13618 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CUL3Q13618 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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