Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRQ13535 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRQ13535 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRQ13535 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRQ13535 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATRQ13535 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATRQ13535 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATRQ13535 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATRQ13535 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRQ13535 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRQ13535 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRQ13535 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRQ13535 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRQ13535 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRQ13535 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRQ13535 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRQ13535 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRQ13535 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRQ13535 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRQ13535 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRQ13535 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRQ13535 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRQ13535 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRQ13535 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRQ13535 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRQ13535 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRQ13535 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATRQ13535 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRQ13535 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRQ13535 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRQ13535 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRQ13535 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRQ13535 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRQ13535 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRQ13535 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRQ13535 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRQ13535 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRQ13535 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRQ13535 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRQ13535 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRQ13535 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRQ13535 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRQ13535 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRQ13535 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRQ13535 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRQ13535 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRQ13535 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRQ13535 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRQ13535 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRQ13535 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRQ13535 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRQ13535 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRQ13535 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRQ13535 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRQ13535 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRQ13535 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRQ13535 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRQ13535 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRQ13535 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRQ13535 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRQ13535 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRQ13535 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRQ13535 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRQ13535 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRQ13535 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRQ13535 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRQ13535 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRQ13535 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRQ13535 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRQ13535 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRQ13535 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRQ13535 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRQ13535 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRQ13535 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRQ13535 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRQ13535 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRQ13535 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRQ13535 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRQ13535 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRQ13535 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRQ13535 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRQ13535 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRQ13535 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRQ13535 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRQ13535 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRQ13535 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRQ13535 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRQ13535 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRQ13535 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRQ13535 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRQ13535 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRQ13535 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRQ13535 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRQ13535 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRQ13535 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRQ13535 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRQ13535 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRQ13535 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRQ13535 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRQ13535 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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