Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP3B2Q13367 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP3B2Q13367 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms