Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDK5R2Q13319 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5R2Q13319 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5R2Q13319 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5R2Q13319 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5R2Q13319 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5R2Q13319 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5R2Q13319 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5R2Q13319 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5R2Q13319 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5R2Q13319 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5R2Q13319 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5R2Q13319 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5R2Q13319 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5R2Q13319 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5R2Q13319 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDK5R2Q13319 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5R2Q13319 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5R2Q13319 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5R2Q13319 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5R2Q13319 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5R2Q13319 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5R2Q13319 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5R2Q13319 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5R2Q13319 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5R2Q13319 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5R2Q13319 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5R2Q13319 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5R2Q13319 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5R2Q13319 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5R2Q13319 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5R2Q13319 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDK5R2Q13319 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5R2Q13319 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5R2Q13319 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5R2Q13319 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5R2Q13319 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDK5R2Q13319 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms