Protein–RNA interactions for Protein: Q13219

PAPPA, Pappalysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,627 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPAQ13219 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
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PAPPAQ13219 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PAPPAQ13219 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PAPPAQ13219 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PAPPAQ13219 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PAPPAQ13219 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PAPPAQ13219 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PAPPAQ13219 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PAPPAQ13219 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PAPPAQ13219 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PAPPAQ13219 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PAPPAQ13219 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PAPPAQ13219 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PAPPAQ13219 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PAPPAQ13219 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PAPPAQ13219 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PAPPAQ13219 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PAPPAQ13219 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PAPPAQ13219 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PAPPAQ13219 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PAPPAQ13219 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PAPPAQ13219 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PAPPAQ13219 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PAPPAQ13219 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PAPPAQ13219 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PAPPAQ13219 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PAPPAQ13219 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PAPPAQ13219 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PAPPAQ13219 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PAPPAQ13219 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PAPPAQ13219 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PAPPAQ13219 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PAPPAQ13219 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PAPPAQ13219 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PAPPAQ13219 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PAPPAQ13219 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PAPPAQ13219 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PAPPAQ13219 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
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PAPPAQ13219 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PAPPAQ13219 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
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PAPPAQ13219 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
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PAPPAQ13219 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
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PAPPAQ13219 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PAPPAQ13219 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
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PAPPAQ13219 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
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PAPPAQ13219 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PAPPAQ13219 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PAPPAQ13219 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PAPPAQ13219 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PAPPAQ13219 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PAPPAQ13219 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PAPPAQ13219 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PAPPAQ13219 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PAPPAQ13219 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PAPPAQ13219 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PAPPAQ13219 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PAPPAQ13219 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PAPPAQ13219 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
PAPPAQ13219 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
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