Protein–RNA interactions for Protein: Q13103

SPP2, Secreted phosphoprotein 24, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPP2Q13103 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPP2Q13103 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPP2Q13103 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPP2Q13103 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPP2Q13103 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPP2Q13103 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPP2Q13103 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPP2Q13103 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPP2Q13103 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPP2Q13103 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPP2Q13103 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPP2Q13103 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPP2Q13103 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SPP2Q13103 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPP2Q13103 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPP2Q13103 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPP2Q13103 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPP2Q13103 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPP2Q13103 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPP2Q13103 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPP2Q13103 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms