Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRAF1Q13077 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF1Q13077 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
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