Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK2Q13002 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GRIK2Q13002 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
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