Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HSPB3Q12988 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms