Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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BNIP1Q12981 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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BNIP1Q12981 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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BNIP1Q12981 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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BNIP1Q12981 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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BNIP1Q12981 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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BNIP1Q12981 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BNIP1Q12981 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BNIP1Q12981 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
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