Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAF2Q12933 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAF2Q12933 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAF2Q12933 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAF2Q12933 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAF2Q12933 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAF2Q12933 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAF2Q12933 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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TRAF2Q12933 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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TRAF2Q12933 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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TRAF2Q12933 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TRAF2Q12933 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
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