Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMARCB1Q12824 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCB1Q12824 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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