Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CPSF1Q10570 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CPSF1Q10570 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CPSF1Q10570 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CPSF1Q10570 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CPSF1Q10570 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CPSF1Q10570 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
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