Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC173Q0VFZ6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC173Q0VFZ6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms