Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EP300Q09472 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EP300Q09472 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EP300Q09472 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EP300Q09472 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EP300Q09472 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EP300Q09472 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EP300Q09472 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EP300Q09472 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EP300Q09472 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EP300Q09472 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EP300Q09472 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EP300Q09472 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EP300Q09472 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EP300Q09472 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EP300Q09472 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EP300Q09472 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EP300Q09472 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EP300Q09472 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EP300Q09472 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
EP300Q09472 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EP300Q09472 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EP300Q09472 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EP300Q09472 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EP300Q09472 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EP300Q09472 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EP300Q09472 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EP300Q09472 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EP300Q09472 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EP300Q09472 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EP300Q09472 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EP300Q09472 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EP300Q09472 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EP300Q09472 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EP300Q09472 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EP300Q09472 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EP300Q09472 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EP300Q09472 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EP300Q09472 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EP300Q09472 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EP300Q09472 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
EP300Q09472 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EP300Q09472 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EP300Q09472 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EP300Q09472 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EP300Q09472 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EP300Q09472 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
EP300Q09472 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EP300Q09472 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EP300Q09472 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EP300Q09472 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EP300Q09472 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EP300Q09472 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EP300Q09472 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EP300Q09472 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EP300Q09472 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EP300Q09472 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EP300Q09472 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EP300Q09472 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EP300Q09472 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EP300Q09472 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
EP300Q09472 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
EP300Q09472 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EP300Q09472 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EP300Q09472 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EP300Q09472 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EP300Q09472 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EP300Q09472 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EP300Q09472 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EP300Q09472 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EP300Q09472 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EP300Q09472 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EP300Q09472 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EP300Q09472 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
EP300Q09472 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EP300Q09472 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EP300Q09472 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EP300Q09472 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
EP300Q09472 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EP300Q09472 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EP300Q09472 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
EP300Q09472 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
EP300Q09472 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EP300Q09472 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EP300Q09472 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EP300Q09472 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EP300Q09472 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EP300Q09472 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EP300Q09472 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EP300Q09472 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EP300Q09472 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EP300Q09472 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EP300Q09472 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EP300Q09472 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
EP300Q09472 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
EP300Q09472 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EP300Q09472 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EP300Q09472 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
EP300Q09472 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EP300Q09472 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms