Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C2orf54Q08AI8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C2orf54Q08AI8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms