Protein–RNA interactions for Protein: Q08004

BUD20, Bud site selection protein 20, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BUD20Q08004 TRS85YDR108W 2097 nt4.92□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 PEX6YNL329C 3093 nt4.92□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 DBF4YDR052C 2115 nt4.92□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 YDR340WYDR340W 303 nt4.92□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 YER188C-AYER188C-A 300 nt4.92□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 RPL29YFR032C-A 180 nt4.92□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 RPL28YGL103W 450 nt4.92□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 YAL044W-AYAL044W-A 333 nt4.92□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 CYB5YNL111C 363 nt4.92□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 YPL025CYPL025C 558 nt4.92□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 RPL14BYHL001W 417 nt4.91□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 BCD1YHR040W 1101 nt4.91□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 RPC10YHR143W-A 213 nt4.91□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 TIM8YJR135W-A 264 nt4.91□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 RPL37AYLR185W 267 nt4.91□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 PEX11YOL147C 711 nt4.91□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 TRM7YBR061C 933 nt4.91□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 ATM1YMR301C 2073 nt4.91□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 APC5YOR249C 2058 nt4.91□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 FRE3YOR381W 2136 nt4.91□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 PWP1YLR196W 1731 nt4.91□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 KRI1YNL308C 1776 nt4.91□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 GLT1YDL171C 6438 nt4.91□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 TUB2YFL037W 1374 nt4.91□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 EXO70YJL085W 1872 nt4.9□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 ELP2YGR200C 2367 nt4.9□□□□□ -1.62
BUD20Q08004 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt4.9□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt4.9□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 YER187WYER187W 426 nt4.9□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt4.9□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 GON7YJL184W 372 nt4.9□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 YMR105W-AYMR105W-A 195 nt4.9□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 SUI1YNL244C 327 nt4.9□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 PRM1YNL279W 1986 nt4.9□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 LCB4YOR171C 1875 nt4.9□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 EMP70YLR083C 2004 nt4.89□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 SOK2YMR016C 2358 nt4.89□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 YDR250CYDR250C 276 nt4.89□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 SMD1YGR074W 441 nt4.89□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 RPB11YOL005C 363 nt4.89□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 MCX1YBR227C 1563 nt4.89□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 OCA5YHL029C 2040 nt4.89□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 STV1YMR054W 2673 nt4.89□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 ATP25YMR098C 1839 nt4.88□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 BEM4YPL161C 1902 nt4.88□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 YOR1YGR281W 4434 nt4.88□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 CYK3YDL117W 2658 nt4.88□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 PSF1YDR013W 627 nt4.88□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 YNL057WYNL057W 333 nt4.88□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt4.88□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 FRE4YNR060W 2160 nt4.88□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 STB2YMR053C 2553 nt4.88□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 VPS41YDR080W 2979 nt4.88□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 SIP1YDR422C 2448 nt4.87□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 PHO2YDL106C 1680 nt4.87□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 KCC4YCL024W 3114 nt4.87□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 ATG33YLR356W 594 nt4.87□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt4.87□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 EGD1YPL037C 474 nt4.87□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 NHP6AYPR052C 282 nt4.87□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 YMR102CYMR102C 2505 nt4.87□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 PTR3YFR029W 2037 nt4.87□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 YKL222CYKL222C 2118 nt4.87□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 VAC14YLR386W 2643 nt4.86□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 YDL011CYDL011C 324 nt4.86□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 ARF1YDL192W 546 nt4.86□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt4.86□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 RIM15YFL033C 5313 nt4.86□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 RAD53YPL153C 2466 nt4.86□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 NAN1YPL126W 2691 nt4.86□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 BIT61YJL058C 1632 nt4.86□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 YAP1802YGR241C 1707 nt4.86□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 REV1YOR346W 2958 nt4.86□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 PDR10YOR328W 4695 nt4.85□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 GCN20YFR009W 2259 nt4.85□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 LHP1YDL051W 828 nt4.85□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 SNU13YEL026W 381 nt4.85□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 IRC3YDR332W 2070 nt4.84□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 MCM2YBL023C 2607 nt4.84□□□□□ -1.63
BUD20Q08004 TIF4631YGR162W 2859 nt4.83□□□□□ -1.64
BUD20Q08004 RPS26BYER131W 360 nt4.83□□□□□ -1.64
BUD20Q08004 RPS23AYGR118W 438 nt4.83□□□□□ -1.64
BUD20Q08004 DOA1YKL213C 2148 nt4.83□□□□□ -1.64
BUD20Q08004 YKR033CYKR033C 426 nt4.83□□□□□ -1.64
BUD20Q08004 LSM2YBL026W 288 nt4.83□□□□□ -1.64
BUD20Q08004 YBR224WYBR224W 516 nt4.83□□□□□ -1.64
BUD20Q08004 DNM1YLL001W 2274 nt4.83□□□□□ -1.64
BUD20Q08004 FAP1YNL023C 2898 nt4.83□□□□□ -1.64
BUD20Q08004 ATP15YPL271W 189 nt4.82□□□□□ -1.64
BUD20Q08004 OPT2YPR194C 2634 nt4.82□□□□□ -1.64
BUD20Q08004 SAP155YFR040W 3009 nt4.82□□□□□ -1.64
BUD20Q08004 MDM32YOR147W 1869 nt4.81□□□□□ -1.64
BUD20Q08004 ELM1YKL048C 1923 nt4.8□□□□□ -1.64
BUD20Q08004 YBR238CYBR238C 2196 nt4.8□□□□□ -1.64
BUD20Q08004 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt4.8□□□□□ -1.64
BUD20Q08004 RFC3YNL290W 1023 nt4.8□□□□□ -1.64
BUD20Q08004 GMC1YDR506C 1827 nt4.8□□□□□ -1.64
BUD20Q08004 AIP1YMR092C 1848 nt4.8□□□□□ -1.64
BUD20Q08004 YHR078WYHR078W 1659 nt4.8□□□□□ -1.64
BUD20Q08004 MSH4YFL003C 2637 nt4.79□□□□□ -1.64
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