Protein–RNA interactions for Protein: Q07960

ARHGAP1, Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP1Q07960 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARHGAP1Q07960 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGAP1Q07960 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGAP1Q07960 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGAP1Q07960 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGAP1Q07960 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGAP1Q07960 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGAP1Q07960 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGAP1Q07960 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGAP1Q07960 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGAP1Q07960 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGAP1Q07960 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGAP1Q07960 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGAP1Q07960 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP1Q07960 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP1Q07960 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP1Q07960 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP1Q07960 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP1Q07960 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP1Q07960 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP1Q07960 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP1Q07960 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP1Q07960 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP1Q07960 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP1Q07960 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP1Q07960 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP1Q07960 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP1Q07960 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP1Q07960 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP1Q07960 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP1Q07960 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP1Q07960 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP1Q07960 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP1Q07960 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGAP1Q07960 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGAP1Q07960 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGAP1Q07960 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGAP1Q07960 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGAP1Q07960 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms