Protein–RNA interactions for Protein: Q06106

MRD1, Multiple RNA-binding domain-containing protein 1, yeast

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRD1	Q06106	CDC123	YLR215C	1083 nt		2.97	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	YAR062W	YAR062W	597 nt		2.97	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	NGL1	YOL042W	1092 nt		2.97	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	DSE4	YNR067C	3354 nt		2.97	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	YBL005W-B	YBL005W-B	5268 nt		2.97	□□□□□ -1.93
MRD1	Q06106	SWC4	YGR002C	1431 nt		2.96	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	SNA4	YDL123W	423 nt		2.96	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	YFL012W-A	YFL012W-A	375 nt		2.96	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	RPS22A	YJL190C	393 nt		2.96	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	MCR1	YKL150W	909 nt		2.96	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	YBR062C	YBR062C	543 nt		2.96	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	RPO41	YFL036W	4056 nt		2.96	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	YDR186C	YDR186C	2634 nt		2.96	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	BIT61	YJL058C	1632 nt		2.96	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	HAA1	YPR008W	2085 nt		2.96	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	TFB1	YDR311W	1929 nt		2.95	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	MST27	YGL051W	705 nt		2.95	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	YIP5	YGL161C	933 nt		2.95	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	RPL14B	YHL001W	417 nt		2.95	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	RPL17B	YJL177W	555 nt		2.95	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	DAD2	YKR083C	402 nt		2.95	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	CSI1	YMR025W	888 nt		2.95	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	RPS16A	YMR143W	432 nt		2.95	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	YMR181C	YMR181C	465 nt		2.95	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	YNL043C	YNL043C	321 nt		2.95	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	GIM3	YNL153C	390 nt		2.95	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	SHS1	YDL225W	1656 nt		2.95	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	ICR1	ICR1	3199 nt		2.94	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	VHR2	YER064C	1518 nt		2.94	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	PTP3	YER075C	2787 nt		2.94	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	DAD1	YDR016C	285 nt		2.94	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	SNO3	YFL060C	669 nt		2.94	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	YAP5	YIR018W	738 nt		2.94	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	ASG7	YJL170C	630 nt		2.94	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	EMC6	YLL014W	327 nt		2.94	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	ATG38	YLR211C	681 nt		2.94	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	YLR271W	YLR271W	825 nt		2.94	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	SNO2	YNL334C	669 nt		2.94	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	YOL029C	YOL029C	606 nt		2.94	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	IKI3	YLR384C	4050 nt		2.94	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	NUM1	YDR150W	8247 nt		2.94	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	SEC26	YDR238C	2922 nt		2.93	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	DBF20	YPR111W	1695 nt		2.93	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	PRP21	YJL203W	843 nt		2.93	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	ECM9	YKR004C	1134 nt		2.93	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	AIM36	YMR157C	768 nt		2.93	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	RRT16	YNL105W	429 nt		2.93	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	LCL1	YPL056C	306 nt		2.93	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	YPR153W	YPR153W	423 nt		2.93	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	RTT10	YPL183C	3042 nt		2.93	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	BOI1	YBL085W	2943 nt		2.93	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	PSY2	YNL201C	2577 nt		2.93	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	MAL33	YBR297W	1407 nt		2.93	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	PCK1	YKR097W	1650 nt		2.92	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	FIN1	YDR130C	876 nt		2.92	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	YGR109W-A	YGR109W-A	873 nt		2.92	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	RSR1	YGR152C	819 nt		2.92	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	YIL082W	YIL082W	873 nt		2.92	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	YIR020C-B	YIR020C-B	735 nt		2.92	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	SFT1	YKL006C-A	294 nt		2.92	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	MIX23	YBL107C	591 nt		2.92	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	RRD2	YPL152W	1077 nt		2.92	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	TMA64	YDR117C	1698 nt		2.92	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	snR5	snR5	204 nt		2.91	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	VPS41	YDR080W	2979 nt		2.91	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	PAU23	YLR037C	375 nt		2.91	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	RPL20A	YMR242C	519 nt		2.91	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	YBL108W	YBL108W	306 nt		2.91	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	YBR051W	YBR051W	351 nt		2.91	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	RPN3	YER021W	1572 nt		2.91	□□□□□ -1.94
MRD1	Q06106	YEL1	YBL060W	2064 nt		2.9	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	MMS1	YPR164W	4224 nt		2.9	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	YDR461C-A	YDR461C-A	243 nt		2.9	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	SRP21	YKL122C	504 nt		2.9	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	CWC24	YLR323C	780 nt		2.9	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	YOR050C	YOR050C	348 nt		2.9	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	SGT1	YOR057W	1188 nt		2.9	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	YPR147C	YPR147C	915 nt		2.9	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	KAR9	YPL269W	1935 nt		2.89	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	SCY1	YGL083W	2415 nt		2.89	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	APC11	YDL008W	498 nt		2.89	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	HPA3	YEL066W	540 nt		2.89	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	PRP38	YGR075C	729 nt		2.89	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	SSP1	YHR184W	1716 nt		2.89	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	YNL235C	YNL235C	432 nt		2.89	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	HEM4	YOR278W	828 nt		2.89	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	Q0017	Q0017	162 nt		2.89	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	TOR1	YJR066W	7413 nt		2.89	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	15S_rRNA	15S_rRNA	1649 nt		2.89	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	SWR1	YDR334W	4545 nt		2.89	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	YDR239C	YDR239C	2364 nt		2.88	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	PDR1	YGL013C	3207 nt		2.88	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	YDL163W	YDL163W	303 nt		2.88	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	TDA2	YER071C	381 nt		2.88	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	YER091C-A	YER091C-A	222 nt		2.88	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	YGR053C	YGR053C	852 nt		2.88	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	YIL012W	YIL012W	342 nt		2.88	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	TMA10	YLR327C	261 nt		2.88	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	INP1	YMR204C	1263 nt		2.88	□□□□□ -1.95
MRD1	Q06106	SFM1	YOR021C	642 nt		2.88	□□□□□ -1.95

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16 ms