Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GBE1Q04446 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GBE1Q04446 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GBE1Q04446 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GBE1Q04446 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GBE1Q04446 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GBE1Q04446 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GBE1Q04446 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GBE1Q04446 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GBE1Q04446 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GBE1Q04446 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GBE1Q04446 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GBE1Q04446 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GBE1Q04446 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
GBE1Q04446 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GBE1Q04446 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms