Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CENPCQ03188 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPCQ03188 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms