Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPARDQ03181 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARDQ03181 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARDQ03181 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARDQ03181 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARDQ03181 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARDQ03181 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARDQ03181 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARDQ03181 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARDQ03181 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARDQ03181 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARDQ03181 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARDQ03181 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARDQ03181 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARDQ03181 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPARDQ03181 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPARDQ03181 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPARDQ03181 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPARDQ03181 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPARDQ03181 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPARDQ03181 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPARDQ03181 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPARDQ03181 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPARDQ03181 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPARDQ03181 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPARDQ03181 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPARDQ03181 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PPARDQ03181 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPARDQ03181 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPARDQ03181 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPARDQ03181 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms