Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ID3Q02535 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ID3Q02535 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ID3Q02535 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ID3Q02535 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ID3Q02535 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ID3Q02535 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ID3Q02535 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ID3Q02535 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ID3Q02535 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ID3Q02535 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ID3Q02535 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ID3Q02535 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ID3Q02535 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ID3Q02535 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ID3Q02535 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ID3Q02535 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ID3Q02535 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ID3Q02535 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ID3Q02535 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ID3Q02535 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ID3Q02535 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ID3Q02535 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ID3Q02535 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ID3Q02535 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ID3Q02535 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ID3Q02535 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ID3Q02535 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ID3Q02535 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ID3Q02535 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ID3Q02535 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ID3Q02535 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ID3Q02535 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ID3Q02535 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ID3Q02535 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ID3Q02535 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ID3Q02535 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ID3Q02535 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ID3Q02535 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ID3Q02535 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ID3Q02535 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ID3Q02535 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ID3Q02535 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ID3Q02535 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ID3Q02535 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ID3Q02535 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ID3Q02535 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ID3Q02535 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ID3Q02535 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ID3Q02535 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ID3Q02535 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ID3Q02535 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ID3Q02535 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ID3Q02535 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ID3Q02535 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ID3Q02535 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ID3Q02535 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ID3Q02535 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ID3Q02535 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ID3Q02535 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ID3Q02535 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ID3Q02535 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ID3Q02535 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ID3Q02535 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ID3Q02535 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ID3Q02535 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ID3Q02535 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ID3Q02535 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ID3Q02535 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ID3Q02535 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ID3Q02535 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ID3Q02535 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ID3Q02535 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ID3Q02535 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ID3Q02535 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ID3Q02535 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ID3Q02535 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ID3Q02535 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ID3Q02535 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ID3Q02535 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ID3Q02535 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ID3Q02535 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ID3Q02535 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ID3Q02535 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ID3Q02535 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ID3Q02535 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ID3Q02535 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ID3Q02535 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ID3Q02535 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ID3Q02535 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ID3Q02535 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ID3Q02535 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ID3Q02535 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ID3Q02535 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ID3Q02535 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ID3Q02535 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ID3Q02535 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ID3Q02535 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ID3Q02535 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ID3Q02535 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms