Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC6A3Q01959 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC6A3Q01959 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms