Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
POU5F1Q01860 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POU5F1Q01860 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms