Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDR2Q01850 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDR2Q01850 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms