Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1DQ01668 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1DQ01668 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1DQ01668 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1DQ01668 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1DQ01668 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1DQ01668 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1DQ01668 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1DQ01668 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1DQ01668 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1DQ01668 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1DQ01668 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1DQ01668 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1DQ01668 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1DQ01668 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1DQ01668 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1DQ01668 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1DQ01668 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1DQ01668 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1DQ01668 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1DQ01668 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1DQ01668 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1DQ01668 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1DQ01668 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1DQ01668 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1DQ01668 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1DQ01668 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1DQ01668 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1DQ01668 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1DQ01668 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1DQ01668 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1DQ01668 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1DQ01668 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1DQ01668 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1DQ01668 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1DQ01668 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1DQ01668 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1DQ01668 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1DQ01668 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1DQ01668 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1DQ01668 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1DQ01668 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1DQ01668 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1DQ01668 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1DQ01668 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1DQ01668 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1DQ01668 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1DQ01668 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1DQ01668 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1DQ01668 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms