Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRF9Q00978 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IRF9Q00978 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms