Protein–RNA interactions for Protein: Q00722

PLCB2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB2Q00722 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLCB2Q00722 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PLCB2Q00722 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PLCB2Q00722 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PLCB2Q00722 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLCB2Q00722 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLCB2Q00722 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLCB2Q00722 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms