Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NFKB2Q00653 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFKB2Q00653 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFKB2Q00653 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NFKB2Q00653 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKB2Q00653 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKB2Q00653 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKB2Q00653 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKB2Q00653 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKB2Q00653 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKB2Q00653 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKB2Q00653 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKB2Q00653 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKB2Q00653 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKB2Q00653 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKB2Q00653 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKB2Q00653 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKB2Q00653 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKB2Q00653 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKB2Q00653 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKB2Q00653 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKB2Q00653 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKB2Q00653 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKB2Q00653 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKB2Q00653 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKB2Q00653 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKB2Q00653 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKB2Q00653 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKB2Q00653 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKB2Q00653 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKB2Q00653 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKB2Q00653 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKB2Q00653 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NFKB2Q00653 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
NFKB2Q00653 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFKB2Q00653 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms