Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HSF1Q00613 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HSF1Q00613 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms