Protein–RNA interactions for Protein: P98177

FOXO4, Forkhead box protein O4, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO4P98177 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOXO4P98177 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOXO4P98177 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOXO4P98177 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOXO4P98177 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOXO4P98177 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXO4P98177 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXO4P98177 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXO4P98177 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXO4P98177 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXO4P98177 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXO4P98177 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXO4P98177 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXO4P98177 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXO4P98177 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXO4P98177 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXO4P98177 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FOXO4P98177 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXO4P98177 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms