Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED6P86452 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED6P86452 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms