Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCNA1P78396 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNA1P78396 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms