Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GTF2IP78347 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GTF2IP78347 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms