Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC5P78333 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC5P78333 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC5P78333 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC5P78333 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC5P78333 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC5P78333 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC5P78333 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC5P78333 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC5P78333 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC5P78333 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC5P78333 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC5P78333 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC5P78333 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPC5P78333 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPC5P78333 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPC5P78333 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC5P78333 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC5P78333 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC5P78333 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC5P78333 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC5P78333 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC5P78333 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC5P78333 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC5P78333 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC5P78333 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC5P78333 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC5P78333 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC5P78333 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC5P78333 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC5P78333 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC5P78333 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC5P78333 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC5P78333 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC5P78333 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC5P78333 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC5P78333 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC5P78333 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC5P78333 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC5P78333 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC5P78333 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC5P78333 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC5P78333 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC5P78333 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC5P78333 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC5P78333 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC5P78333 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC5P78333 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC5P78333 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC5P78333 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC5P78333 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC5P78333 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC5P78333 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC5P78333 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC5P78333 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC5P78333 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC5P78333 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC5P78333 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC5P78333 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC5P78333 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC5P78333 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC5P78333 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC5P78333 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC5P78333 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC5P78333 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC5P78333 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC5P78333 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC5P78333 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC5P78333 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC5P78333 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC5P78333 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC5P78333 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC5P78333 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC5P78333 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC5P78333 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC5P78333 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC5P78333 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC5P78333 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC5P78333 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC5P78333 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC5P78333 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC5P78333 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC5P78333 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC5P78333 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC5P78333 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC5P78333 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC5P78333 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC5P78333 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC5P78333 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC5P78333 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC5P78333 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC5P78333 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC5P78333 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC5P78333 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC5P78333 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC5P78333 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC5P78333 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC5P78333 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC5P78333 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPC5P78333 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms