Protein–RNA interactions for Protein: P62318

SNRPD3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD3P62318 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNRPD3P62318 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNRPD3P62318 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms