Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GFRA1P56159 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GFRA1P56159 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms