Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NAP1L1P55209 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms