Protein–RNA interactions for Protein: P55056

APOC4, Apolipoprotein C-IV, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4P55056 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOC4P55056 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOC4P55056 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOC4P55056 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOC4P55056 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOC4P55056 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOC4P55056 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOC4P55056 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOC4P55056 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOC4P55056 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOC4P55056 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOC4P55056 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOC4P55056 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOC4P55056 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOC4P55056 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOC4P55056 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOC4P55056 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOC4P55056 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOC4P55056 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOC4P55056 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOC4P55056 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
APOC4P55056 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOC4P55056 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
APOC4P55056 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOC4P55056 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOC4P55056 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOC4P55056 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
APOC4P55056 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOC4P55056 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
APOC4P55056 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOC4P55056 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOC4P55056 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOC4P55056 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOC4P55056 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOC4P55056 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOC4P55056 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOC4P55056 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC4P55056 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC4P55056 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC4P55056 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC4P55056 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC4P55056 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC4P55056 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC4P55056 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC4P55056 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC4P55056 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC4P55056 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC4P55056 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC4P55056 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC4P55056 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC4P55056 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC4P55056 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC4P55056 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC4P55056 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC4P55056 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC4P55056 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC4P55056 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC4P55056 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC4P55056 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC4P55056 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC4P55056 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC4P55056 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC4P55056 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC4P55056 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC4P55056 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC4P55056 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOC4P55056 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC4P55056 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC4P55056 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC4P55056 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC4P55056 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC4P55056 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC4P55056 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC4P55056 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC4P55056 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC4P55056 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC4P55056 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC4P55056 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC4P55056 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC4P55056 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC4P55056 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC4P55056 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC4P55056 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC4P55056 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC4P55056 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC4P55056 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC4P55056 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC4P55056 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC4P55056 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOC4P55056 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC4P55056 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC4P55056 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC4P55056 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC4P55056 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC4P55056 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC4P55056 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC4P55056 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC4P55056 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC4P55056 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
APOC4P55056 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms