Protein–RNA interactions for Protein: P54577

YARS, Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YARSP54577 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YARSP54577 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
YARSP54577 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
YARSP54577 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
YARSP54577 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
YARSP54577 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YARSP54577 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YARSP54577 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YARSP54577 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YARSP54577 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
YARSP54577 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
YARSP54577 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
YARSP54577 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
YARSP54577 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
YARSP54577 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
YARSP54577 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YARSP54577 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YARSP54577 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
YARSP54577 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
YARSP54577 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
YARSP54577 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YARSP54577 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YARSP54577 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YARSP54577 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YARSP54577 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YARSP54577 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YARSP54577 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YARSP54577 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YARSP54577 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YARSP54577 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YARSP54577 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YARSP54577 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
YARSP54577 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
YARSP54577 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YARSP54577 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YARSP54577 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YARSP54577 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YARSP54577 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YARSP54577 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YARSP54577 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YARSP54577 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YARSP54577 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
YARSP54577 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YARSP54577 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
YARSP54577 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YARSP54577 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YARSP54577 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YARSP54577 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YARSP54577 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YARSP54577 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
YARSP54577 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YARSP54577 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
YARSP54577 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
YARSP54577 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YARSP54577 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
YARSP54577 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
YARSP54577 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
YARSP54577 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YARSP54577 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YARSP54577 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
YARSP54577 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
YARSP54577 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
YARSP54577 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
YARSP54577 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YARSP54577 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
YARSP54577 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
YARSP54577 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
YARSP54577 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YARSP54577 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YARSP54577 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
YARSP54577 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YARSP54577 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YARSP54577 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
YARSP54577 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YARSP54577 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
YARSP54577 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YARSP54577 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
YARSP54577 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
YARSP54577 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YARSP54577 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YARSP54577 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
YARSP54577 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YARSP54577 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
YARSP54577 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
YARSP54577 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YARSP54577 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YARSP54577 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YARSP54577 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
YARSP54577 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
YARSP54577 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
YARSP54577 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
YARSP54577 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
YARSP54577 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YARSP54577 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
YARSP54577 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YARSP54577 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YARSP54577 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YARSP54577 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YARSP54577 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
YARSP54577 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms