Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNA2D1P54289 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA2D1P54289 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms