Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
COPAP53621 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.29■■□□□ 1
COPAP53621 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPAP53621 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPAP53621 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COPAP53621 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPAP53621 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COPAP53621 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPAP53621 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPAP53621 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
COPAP53621 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPAP53621 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
COPAP53621 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COPAP53621 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COPAP53621 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.28■■□□□ 1
COPAP53621 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPAP53621 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPAP53621 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COPAP53621 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.28■■□□□ 1
COPAP53621 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPAP53621 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COPAP53621 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COPAP53621 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COPAP53621 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COPAP53621 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPAP53621 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
COPAP53621 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPAP53621 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COPAP53621 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COPAP53621 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COPAP53621 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COPAP53621 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
COPAP53621 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COPAP53621 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COPAP53621 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COPAP53621 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COPAP53621 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COPAP53621 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.27■■□□□ 1
COPAP53621 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COPAP53621 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COPAP53621 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
COPAP53621 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
COPAP53621 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
COPAP53621 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPAP53621 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPAP53621 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPAP53621 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPAP53621 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPAP53621 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPAP53621 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPAP53621 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPAP53621 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPAP53621 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
COPAP53621 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
COPAP53621 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPAP53621 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPAP53621 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPAP53621 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPAP53621 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPAP53621 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPAP53621 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPAP53621 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPAP53621 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPAP53621 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
COPAP53621 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPAP53621 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
COPAP53621 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPAP53621 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPAP53621 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
COPAP53621 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPAP53621 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPAP53621 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPAP53621 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPAP53621 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPAP53621 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
COPAP53621 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPAP53621 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPAP53621 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPAP53621 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPAP53621 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPAP53621 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPAP53621 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPAP53621 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPAP53621 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPAP53621 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPAP53621 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPAP53621 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPAP53621 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPAP53621 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPAP53621 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPAP53621 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPAP53621 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
COPAP53621 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
COPAP53621 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPAP53621 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPAP53621 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPAP53621 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPAP53621 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPAP53621 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPAP53621 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms