Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP98P52948 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP98P52948 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP98P52948 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP98P52948 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP98P52948 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP98P52948 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP98P52948 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP98P52948 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP98P52948 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP98P52948 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUP98P52948 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUP98P52948 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUP98P52948 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NUP98P52948 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUP98P52948 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NUP98P52948 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
NUP98P52948 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NUP98P52948 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUP98P52948 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUP98P52948 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NUP98P52948 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NUP98P52948 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NUP98P52948 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUP98P52948 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUP98P52948 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NUP98P52948 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NUP98P52948 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NUP98P52948 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUP98P52948 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NUP98P52948 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP98P52948 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP98P52948 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP98P52948 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP98P52948 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP98P52948 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP98P52948 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP98P52948 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP98P52948 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP98P52948 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP98P52948 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUP98P52948 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP98P52948 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP98P52948 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP98P52948 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP98P52948 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP98P52948 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP98P52948 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP98P52948 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP98P52948 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP98P52948 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP98P52948 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP98P52948 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP98P52948 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP98P52948 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP98P52948 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP98P52948 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP98P52948 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP98P52948 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP98P52948 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUP98P52948 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP98P52948 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP98P52948 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP98P52948 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP98P52948 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP98P52948 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP98P52948 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP98P52948 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP98P52948 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUP98P52948 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP98P52948 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP98P52948 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP98P52948 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP98P52948 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP98P52948 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP98P52948 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP98P52948 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP98P52948 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP98P52948 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP98P52948 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NUP98P52948 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NUP98P52948 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NUP98P52948 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NUP98P52948 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NUP98P52948 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NUP98P52948 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NUP98P52948 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NUP98P52948 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NUP98P52948 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NUP98P52948 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NUP98P52948 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NUP98P52948 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUP98P52948 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUP98P52948 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUP98P52948 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUP98P52948 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUP98P52948 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUP98P52948 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUP98P52948 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NUP98P52948 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms