Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2A1P52655 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2A1P52655 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms