Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEK4P51957 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEK4P51957 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK4P51957 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK4P51957 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK4P51957 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK4P51957 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK4P51957 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK4P51957 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK4P51957 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK4P51957 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK4P51957 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK4P51957 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK4P51957 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK4P51957 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK4P51957 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK4P51957 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK4P51957 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK4P51957 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK4P51957 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK4P51957 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK4P51957 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK4P51957 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK4P51957 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK4P51957 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK4P51957 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEK4P51957 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEK4P51957 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEK4P51957 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEK4P51957 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEK4P51957 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEK4P51957 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEK4P51957 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEK4P51957 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEK4P51957 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEK4P51957 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEK4P51957 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEK4P51957 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NEK4P51957 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEK4P51957 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEK4P51957 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEK4P51957 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEK4P51957 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NEK4P51957 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEK4P51957 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEK4P51957 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEK4P51957 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEK4P51957 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEK4P51957 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEK4P51957 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEK4P51957 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEK4P51957 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEK4P51957 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEK4P51957 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NEK4P51957 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEK4P51957 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEK4P51957 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEK4P51957 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NEK4P51957 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEK4P51957 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEK4P51957 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEK4P51957 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEK4P51957 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEK4P51957 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEK4P51957 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEK4P51957 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEK4P51957 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEK4P51957 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEK4P51957 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEK4P51957 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEK4P51957 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEK4P51957 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEK4P51957 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NEK4P51957 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEK4P51957 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEK4P51957 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEK4P51957 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEK4P51957 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEK4P51957 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEK4P51957 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEK4P51957 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEK4P51957 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEK4P51957 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEK4P51957 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEK4P51957 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK4P51957 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK4P51957 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK4P51957 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK4P51957 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK4P51957 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK4P51957 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK4P51957 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK4P51957 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK4P51957 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK4P51957 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK4P51957 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK4P51957 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK4P51957 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK4P51957 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEK4P51957 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms