Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RORCP51449 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RORCP51449 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RORCP51449 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RORCP51449 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RORCP51449 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RORCP51449 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RORCP51449 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RORCP51449 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RORCP51449 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RORCP51449 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RORCP51449 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RORCP51449 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RORCP51449 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RORCP51449 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RORCP51449 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RORCP51449 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RORCP51449 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RORCP51449 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RORCP51449 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RORCP51449 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RORCP51449 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RORCP51449 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RORCP51449 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RORCP51449 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RORCP51449 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RORCP51449 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RORCP51449 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RORCP51449 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RORCP51449 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RORCP51449 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RORCP51449 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RORCP51449 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RORCP51449 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RORCP51449 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RORCP51449 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RORCP51449 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RORCP51449 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RORCP51449 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RORCP51449 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RORCP51449 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RORCP51449 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RORCP51449 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RORCP51449 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RORCP51449 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RORCP51449 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RORCP51449 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RORCP51449 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RORCP51449 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RORCP51449 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RORCP51449 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RORCP51449 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RORCP51449 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RORCP51449 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RORCP51449 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RORCP51449 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RORCP51449 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RORCP51449 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RORCP51449 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RORCP51449 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RORCP51449 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RORCP51449 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RORCP51449 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RORCP51449 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RORCP51449 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RORCP51449 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RORCP51449 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RORCP51449 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RORCP51449 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RORCP51449 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RORCP51449 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RORCP51449 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RORCP51449 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RORCP51449 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RORCP51449 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RORCP51449 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RORCP51449 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RORCP51449 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RORCP51449 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RORCP51449 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RORCP51449 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RORCP51449 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RORCP51449 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RORCP51449 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RORCP51449 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RORCP51449 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RORCP51449 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RORCP51449 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RORCP51449 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RORCP51449 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RORCP51449 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RORCP51449 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RORCP51449 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RORCP51449 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RORCP51449 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RORCP51449 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RORCP51449 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RORCP51449 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RORCP51449 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RORCP51449 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms