Protein–RNA interactions for Protein: P50993

ATP1A2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A2P50993 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP1A2P50993 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP1A2P50993 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP1A2P50993 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP1A2P50993 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP1A2P50993 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP1A2P50993 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP1A2P50993 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP1A2P50993 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP1A2P50993 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP1A2P50993 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP1A2P50993 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP1A2P50993 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP1A2P50993 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP1A2P50993 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP1A2P50993 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP1A2P50993 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP1A2P50993 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP1A2P50993 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP1A2P50993 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP1A2P50993 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP1A2P50993 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP1A2P50993 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP1A2P50993 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP1A2P50993 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP1A2P50993 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP1A2P50993 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP1A2P50993 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP1A2P50993 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP1A2P50993 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP1A2P50993 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP1A2P50993 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP1A2P50993 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP1A2P50993 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP1A2P50993 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP1A2P50993 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP1A2P50993 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP1A2P50993 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP1A2P50993 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP1A2P50993 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP1A2P50993 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP1A2P50993 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP1A2P50993 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP1A2P50993 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP1A2P50993 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP1A2P50993 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP1A2P50993 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP1A2P50993 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP1A2P50993 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms