Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF6P49848 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF6P49848 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF6P49848 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF6P49848 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF6P49848 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF6P49848 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF6P49848 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF6P49848 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF6P49848 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TAF6P49848 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF6P49848 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF6P49848 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF6P49848 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF6P49848 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF6P49848 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF6P49848 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF6P49848 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF6P49848 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF6P49848 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF6P49848 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF6P49848 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF6P49848 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF6P49848 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF6P49848 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF6P49848 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF6P49848 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF6P49848 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF6P49848 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF6P49848 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF6P49848 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF6P49848 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF6P49848 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF6P49848 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF6P49848 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF6P49848 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF6P49848 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF6P49848 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF6P49848 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF6P49848 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF6P49848 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF6P49848 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF6P49848 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF6P49848 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF6P49848 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF6P49848 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF6P49848 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF6P49848 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF6P49848 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF6P49848 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF6P49848 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF6P49848 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF6P49848 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF6P49848 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF6P49848 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF6P49848 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF6P49848 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF6P49848 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF6P49848 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF6P49848 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF6P49848 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF6P49848 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF6P49848 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF6P49848 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF6P49848 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF6P49848 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF6P49848 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF6P49848 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF6P49848 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF6P49848 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF6P49848 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF6P49848 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF6P49848 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF6P49848 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF6P49848 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF6P49848 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF6P49848 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF6P49848 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF6P49848 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF6P49848 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF6P49848 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF6P49848 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF6P49848 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF6P49848 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF6P49848 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF6P49848 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF6P49848 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF6P49848 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF6P49848 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF6P49848 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF6P49848 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF6P49848 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF6P49848 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF6P49848 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF6P49848 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF6P49848 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF6P49848 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF6P49848 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF6P49848 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF6P49848 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms