Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNTAP49354 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNTAP49354 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNTAP49354 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNTAP49354 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNTAP49354 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FNTAP49354 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FNTAP49354 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FNTAP49354 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FNTAP49354 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FNTAP49354 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FNTAP49354 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FNTAP49354 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FNTAP49354 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FNTAP49354 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FNTAP49354 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FNTAP49354 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FNTAP49354 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FNTAP49354 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FNTAP49354 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FNTAP49354 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FNTAP49354 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FNTAP49354 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FNTAP49354 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
FNTAP49354 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
FNTAP49354 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FNTAP49354 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FNTAP49354 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FNTAP49354 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FNTAP49354 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FNTAP49354 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FNTAP49354 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FNTAP49354 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FNTAP49354 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FNTAP49354 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FNTAP49354 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FNTAP49354 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FNTAP49354 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FNTAP49354 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FNTAP49354 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FNTAP49354 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FNTAP49354 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FNTAP49354 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FNTAP49354 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FNTAP49354 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FNTAP49354 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FNTAP49354 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FNTAP49354 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FNTAP49354 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FNTAP49354 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FNTAP49354 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FNTAP49354 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FNTAP49354 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FNTAP49354 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FNTAP49354 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FNTAP49354 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FNTAP49354 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FNTAP49354 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FNTAP49354 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FNTAP49354 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FNTAP49354 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FNTAP49354 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FNTAP49354 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FNTAP49354 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FNTAP49354 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FNTAP49354 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FNTAP49354 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FNTAP49354 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FNTAP49354 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FNTAP49354 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FNTAP49354 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FNTAP49354 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FNTAP49354 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FNTAP49354 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FNTAP49354 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FNTAP49354 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FNTAP49354 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FNTAP49354 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FNTAP49354 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FNTAP49354 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FNTAP49354 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FNTAP49354 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FNTAP49354 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FNTAP49354 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FNTAP49354 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FNTAP49354 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FNTAP49354 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FNTAP49354 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FNTAP49354 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FNTAP49354 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FNTAP49354 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FNTAP49354 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FNTAP49354 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FNTAP49354 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FNTAP49354 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FNTAP49354 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FNTAP49354 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FNTAP49354 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FNTAP49354 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FNTAP49354 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms